在佩戴角膜接触镜的患者中，感染性角膜炎的发生率明显增加^[29-30]。对佩戴角膜接触镜的患者进行检测，发现其眼表菌群发生了明显改变^[30]。最丰富的4个属是假单胞菌、内水杆菌、葡萄球菌和角杆菌，进一步发现这样的改变增加了感染性角膜炎的发生风险，导致隐形眼镜相关的细菌性角膜炎。

2.2 结膜炎与眼表菌群

    结膜炎病因复杂，可以分为感染性结膜炎以及非感染性结膜炎。感染性结膜炎中以细菌感染性结膜炎为主，赵荣超团队透过细菌性结膜炎患者1 350例，检出以革兰氏阳性为主，主要为表皮葡萄球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、溶血葡萄球菌、产气葡萄菌等^[31]。而小儿急性细菌性结膜炎主要为金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌和流感嗜血杆菌，可能与解剖结构与免疫系统发育的不完善有关^[32]。

    非感染性结膜炎主要是过敏性结膜炎，在过敏性结膜炎患者中，菌群的多样性较一般正常人丰富，同时发现拟杆菌门、放线菌门以及蓝藻菌门的细菌数量增加；此外，在过敏性结膜炎中，眼部菌群和鼻部的菌群存在相互作用，鼻泪管在解剖学上连接眼的泪囊和鼻腔，过敏性结膜炎的患者可能透过眼泪或摩擦鼻腔使结膜与鼻部的菌群互相产生流动，结膜的共生菌群的变化增加了对疾病的影响^[33]。

2.3 睑缘炎与眼表菌群

    睑缘炎是指眼睑及其包括皮肤、睫毛和睑板腺在内的相关附属组织的炎症为特征的一类疾病。典型的睑缘炎患者前后睑缘可同时受累，通常呈慢性间歇性发作^[34]。睑缘的长期慢性炎症会导致睑缘溃疡、干眼和睑缘炎相关角结膜病变等，但目前睑缘炎的病因及致病机制尚未明确^[35]。研究^[36-37]指出：与正常人相比，睑缘炎患者的眼表菌群多样性无差异，睑缘炎患者中丙酸杆菌、葡萄球菌、不动杆菌和棒状杆菌属成员被确定为眼睑或睑炎的主要微生物群。但睑缘炎患者眼表带菌量要高于正常人，且革兰氏阳性球菌在菌群占有的比例不同，而厌氧菌带菌量要低于正常人[38]。睑缘炎带菌量的增加造成了炎性反应的延长，而厌氧菌的痤疮丙酸杆菌低于正常人则可能是睑缘炎的一个保护因素。临床上的睑缘炎与蠕行螨高度相关。蠕形螨性睑缘炎患者结膜囊内有不同程度的细菌菌群失衡，而蠕形螨作为转移皮肤和环境菌群的载体可能是其潜在的发病机制^[39]。在睑缘炎患者和健康对照中发现了混合皮肤微生物菌群，由此推测人的睑缘炎可能是由混合皮肤微生物菌群的感染引起的；而蠕形螨作为载体增加了将环境菌群带入到眼部的机会。因为眼部健康和睑缘炎可能取决于眼睛和眼表菌群之间的相互作用，维持眼部微生物群之间的平衡或共生生长可能对睑缘炎的预防很重要。

2.4 干眼与眼表菌群

    干眼是以泪膜功能异常为主要特征的眼部疾病，常伴有眼干涩感、异物感等眼部不适症状，分为泪液生成不足型干眼和蒸发过强型干眼^[40]。在干眼中，通过培养鉴定出的大多数细菌是凝固酶阴性的葡萄球菌；在进一步通过16SrDNA的细菌DNA扩增测序发现，在干眼的患者含有眼表非典型的菌群，包括克雷伯氏菌、红串红球菌和欧文氏菌^[3,41]。干眼患者正常菌群的结构发生变化，相较健康的眼表环境的菌群分布，特有菌群的增加破坏原有的微环境平衡也提示了机会致病菌的可能性。而同时发现这些菌群的增加与杯状细胞密度降低有关。杯状细胞的减少及丧失是干眼的特征之一，而杯状细胞的丢失表现为泪黏液蛋白5 AC(mucin 5 AC，MUC5 AC)水平的降低使眼表高渗状态持续、恶化，加重干眼程度。干燥综合征是一种特殊类型的泪液生成不足型干眼。通过16SrDNA的细菌DNA扩增测序，发现干燥综合征患者眼表菌群的多样性较正常人高，以大肠埃希菌等革兰氏阴性杆菌最为常见^[42]，部分机会致病菌的丰度明显增加，如假单胞菌、假葡萄球菌、链球菌、不动菌等致原菌比例较高^[43]。不同于健康眼表菌群的分布，这些变化可能与严重的眼表异常有关，包括上皮损伤、水蛋白层和黏蛋白层减少，提示了更高比例的潜在致原微生物。蒸发过强型干眼主要为睑板腺功能障碍。虽然在睑板腺功能患者中菌群的数量没有明显差异，但是存在a和b统计学差异，推测眼表菌群失调与睑板腺功能障碍密切相关^[44]。有研究^[41]进一步发现严重睑板腺功能障碍患者组的细菌类型数量明显高于健康对照组，睑板腺体脂质异常被认为与眼表微生物群组成的变化有关。睑板腺管阻塞导致的脂质积累限制了其杀菌能力，从而增强了眼表微生物的增殖。研究^[45]显示：睑板腺功能障碍患者可检测出含有大量的大肠弯曲杆菌、空肠弯曲杆菌和屎肠球菌病原体，这些细菌在健康对照组中几乎不存在，正常微生物群落的变化和优势菌的转化可能与睑板腺功能障碍有关，较高的杆菌含量也提示了睑板腺功能障碍相关的干眼可能与睑缘炎和眼表蠕形螨感染有关。目前为止，在没有明显的临床感染的情况下，对于干眼的患者是否需要进行抗生素干预仍然存在争议，但在干眼患者中，更容易产生抗氟喹诺酮类结膜细菌^[41]。这些结果可能有助于预防和治疗干眼患者诱发感染性角膜结膜炎。